MTD 243-670 manuály

Mtd 243-670 Uživatelský manuál (186 strany)

Značka: Mtd | Kategorie: ne | Velikost: 2.32 MB |

Němec

Tabulka s obsahem

Inhaltsverzeichnis

3

Abkürzungsverzeichnis

8

1 Einleitung

12

2 Material und Methoden

16

2.2 Nährmedien und Puffer

17

2.2.2 Medienzusätze

17

2.3.1 Zellanzucht

18

2.3.2 Stammhaltung

20

2.4.1 Geräte und Lösungen

20

20x TAE-Puffer

22

2.4.10 Scheren von DNA

25

2.5.1 Restriktion

26

2.5.2 Dephosphorylierung

26

50 µl Ansatz

27

70 µl Ansatz

27

2.5.5 Ligation

28

2.6.1 TOPO TA-Klonierung

28

4 µl Ansatz

29

2.7 Amplifikationen

30

2.8 Genbanken

33

2.8.1 Plasmidbanken

34

2.9 Sequenzierung

34

„½-LGA“-Sequenzieransatz

35

Stop-Mix

37

MegaBACE-Sequenzieransatz

37

2.11 Lückenschluß

39

2.11.1 Primerwalking

39

2.11.2 Lückenschluß mit PCR

40

2.11.3 Multiplex-PCR

41

2.12 BLAST

42

2.12.1 Bidirektionaler BLAST

42

2.13.3 Annotation in ERGO

44

2.14 Kumulativer GC-Skew

46

3 Ergebnisse

48

Pile-ups assemblieren

53

Pile-ups

53

Bsp143I

56

3.I.1.5 Lückenschluß

58

3.I.1.6 Sekundärstrukturen

58

R. eutropha H16 werden noch

59

3.I.2 Sequenzanalyse

60

3.I.2.1 G+C-Gehalt

63

Bu. pseudomallei K96243

65

Bo. bronchiseptica RB50

65

3.I.2.3 RNA-Gene

66

3.I.2.5 Annotation

68

R. eutropha (H16_B1213)

80

R. eutropha nachge

80

R. eutropha

81

et al., 1974)

81

R. eutropha um zwei weitere

81

3.I.4.2.1.4 Acetoin-Abbau

88

3.I.4.2.2.1 Cyanat-Hydratase

89

3.I.4.2.2.2 Formamidase

89

3.I.4.4 Kdp-ATPase

92

3.I.4.5 Begeißelung

93

R. solanacearum, die aller

94

5 7 8 9 10 11 126 13 14

96

3.I.4.6.2 Potentielle Toxine

97

3.I.4.6.2.1 RTX-Toxine

97

3.I.4.6.2.2 Tc-Toxine

99

eutropha iden

100

3.II.1.1 Strategieanpassung

101

3.II.1.2 Rohsequenzierung

102

Anzahl der Sequenzläufe

103

Sequenzlücken

103

3.II.1.4 Lückenschluß

104

3.II.2 Sequenzanalyse

106

Deletion

107

Gene der Methanogenese

108

Hoch-exprimierte Gene

108

RNA-Gene

108

Skalierung

108

(1998)

110

ERGEBNISSE KAPITEL 3

111

Methanogenese

113

Methanol + H

113

Msp. stadtmanae

115

Mth. thermautotrophicus

115

3.II.4 CO

117

-Reduktionsweg

117

3.II.5 Genomvergleiche

121

GKxxxKxNGRT MKNK

129

DISKUSSION KAPITEL 4

136

R. eutropha H16

141

R. eutropha JMP134

141

R. solanacearum GMI1000

141

R. metallidurans CH34

141

R. eutropha H16 C. necator N1

143

4.I.10 Ausblick

144

4.II.3 Kommensalismus

147

4.II.3.1 Zellwandsynthese

148

4.II.3.2 Überlange ORFs

150

4.II.5 Ausblick

154

ZUSAMMENFASSUNG KAPITEL 5

155

Burkholderiaceae

155

Msp. stadtmanae-spezifischer

157

6 Literaturverzeichnis

158

Lebenslauf

186

Mtd 243-670 Uživatelský manuál (101 strany)

Značka: Mtd | Kategorie: ne | Velikost: 1.95 MB |

Němec

Tabulka s obsahem

auf Selenmangel

1

Inhaltsverzeichnis

4

TÄMME V1 UND V1

6

1 Abkürzungsverzeichnis

7

2 Zusammenfassung

9

3 Einleitung

11

4 Material und Methoden

22

4.5 Oligonukleotide

23

4 Material und Methoden

24

4.6 Phagenbank

25

4.7 Plasmide

25

5807 bp

28

4.9.11 Primer Extension

33

4.9.12 RT-PCR

34

4.9.18 Southern-Blot-Analyse

36

4.9.21 Northern-Blot-Analyse

38

5 Ergebnisse

42

Gens sdmA

53

RTmetIIfw

70

RTmetIIB

70

RTmetIIr

70

RTpac RTmetIrvB

70

6 Diskussion

71

7 Literaturverzeichnis

84

Lebenslauf :

100

Mtd 243-670 Uživatelský manuál (144 strany)

Značka: Mtd | Kategorie: ne | Velikost: 8.50 MB |

Němec

Tabulka s obsahem

EIDESSTATTLICHE ERKLÄRUNG

3

VERÖFFENTLICHUNGEN

5

SUMMARY

6

ZUSAMMENFASSUNG

8

6 Literatur

12

7 Anhang

12

ABKÜRZUNGEN

13

ABBILDUNGEN

15

GLEICHUNGEN

16

TABELLEN

17

1 Einleitung

18

(nach Thauer et al. (12))

20

Tetrahydromethanopterin (H

22

Tetrahydrofolat (H

22

2 Material

31

D-Biotin Fluka, München

36

3 Methoden

41

D-Biotin) eluiert

62

Die Negative wurde mittels

68

Puffer B.2

74

Fraktionen mit MtrA-H

75

~ 670 kDa

75

~ 350 kDa

75

[IPTG]/[mM]

85

[AHT]/[ng/mL]

85

Vitamin B

87

ist in grün dargestellt

99

4 Ergebnisse

101

Abbildung 4.18:

101

Abbildung 4.21: a)

104

5 Diskussion

105

haben. Wann genau es

106

7 Anhang 7 Anhang

134

DANKSAGUNG

143

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144

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